历史沿革
明朝初年，萧县领7乡，辖77村，马井属红亭乡曲里村。
清同治末年(1875年)萧县辖8乡，编户37户，马井属孝义乡曲里铺寨。
民国20年(1931年)萧县辖10区211个乡，36个镇，马井属第六区区里镇。
民国23年4月1日，全县10个区合并为5个区，第一、六区合并为第一区，马井属第一区，区公所驻县城。
1949年(民国38年)，全县置10个区，马井属郝集区。同年秋，棠张、褚栏划归萧县，全县共12个区，208个乡，马井仍属郝集区。
1950年9月，全县改为17个区，马井乡属杨楼区管辖。
1951年元月，全县13个区，成立马井区。
1958年9月，全县设8个区，62个公社，成立马井公社，属杨楼区管辖。
1962年元月，全县设8个区，62个公社，成立马井公社，属杨楼区管辖。
1980年，全县设9个区，马井区辖马井、郝庄、闫集、道口、朱集、穆集6个乡。
1992年3月，撤区并乡，成立马井镇，原马井、郝庄、道口、朱集四个乡合并成为马井镇。
自然条件
1、地理位置及地形：马井镇位于萧县县城西北15公里处，镇域四周与杨楼、闫集、酒店、赵庄、杜楼、圣泉等乡镇毗邻。镇域地形为平原。
2、水利设施：镇区内水系属新汴河水系，有港河、湘西河、大沙河、利民沟4条河道，其中利民沟、大沙河承接外水，为防洪河道，长27公里。大沟有六里沟、萧黄河、北湘西河、老湘西河、曲仙河等。灌溉用水以地下水为主，机井灌溉。
行政区划：全镇辖15个行政村(原42个)，138个自然村，人口8.2万人，其中非农业人口约2000人。镇域总面积面积112平方公里，耕地面积68平方公里。
马井镇是一个农业大镇，土地肥沃，灌溉便利，种植多样化，除盛产小麦、玉米等粮食作物外，许多土特产驰名在外。
全镇2024年完成夏收小麦9.18万亩，种收玉米7.51万亩，秋收大豆0.93万亩，粮食总产量稳中有进。全镇生猪出栏5.92万头，牛出栏0.85万头，羊出栏1.6万只，家禽出栏70万羽，全年肉类总产量约6941吨。
2024年马井镇重大建设项目中徐淮阜高速项目，占地约90亩，投资970万元;S405改建项目，占地约406亩，投资4000万元;徐商高速项目，占地约990亩，投资8500万元;其中，马井镇精品肉牛标准化养殖基地建设项目，占地约170亩，总投资1.5亿元，致力于打造集肉牛繁育、饲养、屠宰、加工、销售一体的全产业链条;引江济淮二期工程，马井镇共涉及麻堤口、许破楼、吴九店三村，占地750亩，投资3500万元;在“三区三线”划定中超前规划预留800亩有条件建设区，入选浙江丰岛集团10亿元北方食品加工基地选址库。
2025年8月一般公共预算收入2467240.99元。
