2007年12月12日，砀山县委县政府对原玄庙镇与权集乡进行合并，12月30日，镇政府所在地由玄庙街迁至果园场。2019年，省农垦集团将果园场社会化职能移交给玄庙镇政府，自此，一个下辖18个行政村(社区)，166个自然村，总面积约145平方公里，人口约10万人，耕地1.03万亩，果林面积14.5万亩，基本农田7073.4亩，村庄面积3.1万余亩，横跨黄河故道近17公里的皖北大镇应运而生。
玄庙镇位于砀山北部，素有砀山“北大门”之称，东临周寨，西靠官庄，南接砀城，北连单县。101省道、济祁高速贯穿南北，237国道从南部斜穿而过，交通十分便利。刘庞沟、孙庄沟等大小十道沟纵横，复新河、小寨河、苗城河、黑水河等四条河飘然而过，更有黄河故道蜿蜒其中，延绵30余里。故道两岸年年岁岁梨花飘香、乌龙披雪，岁岁年年果实硕硕、金梨坠树。四季更替，演绎着春华秋实，谱写出勤劳、朴实、积极上进的一代代玄庙人为建设美好家园而辛勤劳作的美好乐章。
2024年，全年财政总收入达1231.5万元，其中地方财政收入610.91万元，同比增长8.76%;固定资产投资完成3.6亿元，增幅达25.3%;新增1家规上企业，规上工业总产值实现4200万元，全年经济增幅达8.3%;完成省外投资项目4个，投资总额5.1亿元，社零销售额完成5739.5万元，同比增长24.7%。
2024年，镇内拥有6大出菇基地，年产各类菌菇超3100吨，依托野居、菌之家菌菇种植专业合作社，大力发展庭院经济，户均增收达2300余元。2024年，全镇17个行政村村级集体经济收入均超85万元，其中9个村更是突破100万元。
2024年，我镇投入资金906.77万元，成功实施并投入使用肉牛养殖基地、陈庞庄道路建设、沟河整治三个到村项目以及25个衔接资金项目;全年发放光伏到村收益456.97万元;开发公益性岗位704个;春秋两季资助脱贫学生267人;发放外出务工脱贫人口交通补助17.81万元;发放脱贫户特色种养业奖补资金179.8万元;小额信贷新增466户;完成农村危房改造6户;新纳入监测对象20户55人，实现脱贫人口和监测对象基本医疗保险全覆盖。
2025年6月份经济运行数据及分析
2025年有规上工业2家。6月累计产值496万，同比上升1.1%。
2025年有限上商贸企业3家，6月份限上零售总额297万，同比增长14.3%。
6月份累计完成投资1565万，同比上升1.4%。
